Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lmo3Q8BZL8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lmo3Q8BZL8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lmo3Q8BZL8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lmo3Q8BZL8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lmo3Q8BZL8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lmo3Q8BZL8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmo3Q8BZL8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo3Q8BZL8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmo3Q8BZL8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo3Q8BZL8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmo3Q8BZL8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmo3Q8BZL8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo3Q8BZL8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms