Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdh12Q8BYK4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdh12Q8BYK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh12Q8BYK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh12Q8BYK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh12Q8BYK4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh12Q8BYK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh12Q8BYK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms