Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX35

Eda2r, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 27, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eda2rQ8BX35 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Eda2rQ8BX35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Eda2rQ8BX35 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Eda2rQ8BX35 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Eda2rQ8BX35 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eda2rQ8BX35 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eda2rQ8BX35 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms