Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm4aQ8BW72 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kdm4aQ8BW72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kdm4aQ8BW72 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kdm4aQ8BW72 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kdm4aQ8BW72 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kdm4aQ8BW72 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm4aQ8BW72 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms