Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Acbd3Q8BMP6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Acbd3Q8BMP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acbd3Q8BMP6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acbd3Q8BMP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Acbd3Q8BMP6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Acbd3Q8BMP6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acbd3Q8BMP6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms