Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd55Q8BLD6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd55Q8BLD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd55Q8BLD6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd55Q8BLD6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd55Q8BLD6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ankrd55Q8BLD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms