Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GopcQ8BH60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GopcQ8BH60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GopcQ8BH60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GopcQ8BH60 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GopcQ8BH60 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GopcQ8BH60 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GopcQ8BH60 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GopcQ8BH60 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GopcQ8BH60 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GopcQ8BH60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GopcQ8BH60 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GopcQ8BH60 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GopcQ8BH60 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms