Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnot10Q8BH15 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnot10Q8BH15 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cnot10Q8BH15 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot10Q8BH15 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnot10Q8BH15 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot10Q8BH15 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot10Q8BH15 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot10Q8BH15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot10Q8BH15 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms