Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pld4Q8BG07 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pld4Q8BG07 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pld4Q8BG07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pld4Q8BG07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pld4Q8BG07 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pld4Q8BG07 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pld4Q8BG07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pld4Q8BG07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms