Protein–RNA interactions for Protein: Q810P3

Cdkn3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn3Q810P3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdkn3Q810P3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkn3Q810P3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkn3Q810P3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkn3Q810P3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdkn3Q810P3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkn3Q810P3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkn3Q810P3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdkn3Q810P3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkn3Q810P3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdkn3Q810P3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms