Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp8Q80YR6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbbp8Q80YR6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp8Q80YR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp8Q80YR6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp8Q80YR6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8Q80YR6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp8Q80YR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp8Q80YR6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms