Protein–RNA interactions for Protein: Q80YQ8

Rmnd5a, Protein RMD5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmnd5aQ80YQ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rmnd5aQ80YQ8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rmnd5aQ80YQ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rmnd5aQ80YQ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rmnd5aQ80YQ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rmnd5aQ80YQ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rmnd5aQ80YQ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rmnd5aQ80YQ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rmnd5aQ80YQ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms