Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc1Q80VQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc1Q80VQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc1Q80VQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc1Q80VQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc1Q80VQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lrrc1Q80VQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc1Q80VQ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc1Q80VQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc1Q80VQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc1Q80VQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc1Q80VQ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc1Q80VQ1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc1Q80VQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc1Q80VQ1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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