Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rps6ka6Q7TPS0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rps6ka6Q7TPS0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rps6ka6Q7TPS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rps6ka6Q7TPS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rps6ka6Q7TPS0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rps6ka6Q7TPS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rps6ka6Q7TPS0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rps6ka6Q7TPS0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rps6ka6Q7TPS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka6Q7TPS0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rps6ka6Q7TPS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rps6ka6Q7TPS0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rps6ka6Q7TPS0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rps6ka6Q7TPS0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rps6ka6Q7TPS0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms