Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp397Q7TNK4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zfp397Q7TNK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Zfp397Q7TNK4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zfp397Q7TNK4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zfp397Q7TNK4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zfp397Q7TNK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfp397Q7TNK4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfp397Q7TNK4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms