Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SugctQ7TNE1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SugctQ7TNE1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SugctQ7TNE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SugctQ7TNE1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SugctQ7TNE1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SugctQ7TNE1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SugctQ7TNE1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SugctQ7TNE1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SugctQ7TNE1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SugctQ7TNE1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SugctQ7TNE1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SugctQ7TNE1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SugctQ7TNE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms