Protein–RNA interactions for Protein: Q794H2

Nap1l3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nap1l3Q794H2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nap1l3Q794H2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nap1l3Q794H2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nap1l3Q794H2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nap1l3Q794H2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nap1l3Q794H2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nap1l3Q794H2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nap1l3Q794H2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nap1l3Q794H2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nap1l3Q794H2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nap1l3Q794H2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nap1l3Q794H2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nap1l3Q794H2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nap1l3Q794H2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms