Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smim12Q78RX3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smim12Q78RX3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Smim12Q78RX3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smim12Q78RX3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smim12Q78RX3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smim12Q78RX3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms