Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp34Q6ZQ93 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp34Q6ZQ93 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp34Q6ZQ93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp34Q6ZQ93 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp34Q6ZQ93 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp34Q6ZQ93 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp34Q6ZQ93 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp34Q6ZQ93 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp34Q6ZQ93 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp34Q6ZQ93 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp34Q6ZQ93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp34Q6ZQ93 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Usp34Q6ZQ93 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp34Q6ZQ93 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp34Q6ZQ93 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms