Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GcsamQ6RFH4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GcsamQ6RFH4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GcsamQ6RFH4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GcsamQ6RFH4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GcsamQ6RFH4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GcsamQ6RFH4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms