Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pabpc4Q6PHQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pabpc4Q6PHQ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pabpc4Q6PHQ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pabpc4Q6PHQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pabpc4Q6PHQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pabpc4Q6PHQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pabpc4Q6PHQ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms