Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1F6

Ppp2r2a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2aQ6P1F6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp2r2aQ6P1F6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp2r2aQ6P1F6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp2r2aQ6P1F6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp2r2aQ6P1F6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp2r2aQ6P1F6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp2r2aQ6P1F6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp2r2aQ6P1F6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp2r2aQ6P1F6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp2r2aQ6P1F6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp2r2aQ6P1F6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms