Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arhgap20Q6IFT4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arhgap20Q6IFT4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap20Q6IFT4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap20Q6IFT4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap20Q6IFT4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap20Q6IFT4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap20Q6IFT4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms