Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
N4bp1Q6A037 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
N4bp1Q6A037 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
N4bp1Q6A037 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
N4bp1Q6A037 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
N4bp1Q6A037 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
N4bp1Q6A037 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
N4bp1Q6A037 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms