Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab3ipQ68EF0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3ipQ68EF0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3ipQ68EF0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab3ipQ68EF0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab3ipQ68EF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab3ipQ68EF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab3ipQ68EF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab3ipQ68EF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms