Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BC080695Q66JY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BC080695Q66JY9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BC080695Q66JY9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC080695Q66JY9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC080695Q66JY9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BC080695Q66JY9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BC080695Q66JY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC080695Q66JY9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms