Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SpegQ62407 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SpegQ62407 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SpegQ62407 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SpegQ62407 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SpegQ62407 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpegQ62407 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SpegQ62407 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpegQ62407 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpegQ62407 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpegQ62407 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpegQ62407 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SpegQ62407 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms