Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Taf6Q62311 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Taf6Q62311 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf6Q62311 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf6Q62311 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf6Q62311 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Taf6Q62311 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Taf6Q62311 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Taf6Q62311 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms