Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prkd1Q62101 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prkd1Q62101 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prkd1Q62101 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prkd1Q62101 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prkd1Q62101 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prkd1Q62101 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms