Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt33bQ61897 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt33bQ61897 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt33bQ61897 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Krt33bQ61897 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt33bQ61897 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt33bQ61897 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms