Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ctnna2Q61301 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ctnna2Q61301 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ctnna2Q61301 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ctnna2Q61301 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ctnna2Q61301 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ctnna2Q61301 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ctnna2Q61301 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ctnna2Q61301 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctnna2Q61301 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ctnna2Q61301 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna2Q61301 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna2Q61301 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms