Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms