Protein–RNA interactions for Protein: Q60864

Stip1, Stress-induced-phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stip1Q60864 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stip1Q60864 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Stip1Q60864 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stip1Q60864 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stip1Q60864 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stip1Q60864 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stip1Q60864 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stip1Q60864 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stip1Q60864 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms