Protein–RNA interactions for Protein: Q60787

Lcp2, Lymphocyte cytosolic protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp2Q60787 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lcp2Q60787 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lcp2Q60787 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lcp2Q60787 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lcp2Q60787 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcp2Q60787 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lcp2Q60787 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lcp2Q60787 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lcp2Q60787 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcp2Q60787 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcp2Q60787 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms