Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr1h2Q60644 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1h2Q60644 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1h2Q60644 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1h2Q60644 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1h2Q60644 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr1h2Q60644 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr1h2Q60644 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms