Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Sin3aQ60520 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sin3aQ60520 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Sin3aQ60520 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sin3aQ60520 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Sin3aQ60520 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Sin3aQ60520 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Sin3aQ60520 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Sin3aQ60520 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Sin3aQ60520 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Sin3aQ60520 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Sin3aQ60520 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sin3aQ60520 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Sin3aQ60520 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sin3aQ60520 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sin3aQ60520 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.3 ms