Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam46cQ5SSF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam46cQ5SSF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam46cQ5SSF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam46cQ5SSF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam46cQ5SSF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam46cQ5SSF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam46cQ5SSF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam46cQ5SSF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam46cQ5SSF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam46cQ5SSF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam46cQ5SSF7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam46cQ5SSF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam46cQ5SSF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam46cQ5SSF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam46cQ5SSF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam46cQ5SSF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam46cQ5SSF7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam46cQ5SSF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam46cQ5SSF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam46cQ5SSF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam46cQ5SSF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam46cQ5SSF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam46cQ5SSF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam46cQ5SSF7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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