Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRT8

Ccnjl, Cyclin-J-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjlQ5SRT8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CcnjlQ5SRT8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CcnjlQ5SRT8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CcnjlQ5SRT8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CcnjlQ5SRT8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CcnjlQ5SRT8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CcnjlQ5SRT8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CcnjlQ5SRT8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CcnjlQ5SRT8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CcnjlQ5SRT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms