Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Afap1l2Q5DTU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Afap1l2Q5DTU0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Afap1l2Q5DTU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Afap1l2Q5DTU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Afap1l2Q5DTU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Afap1l2Q5DTU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Afap1l2Q5DTU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Afap1l2Q5DTU0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Afap1l2Q5DTU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms