Protein–RNA interactions for Protein: Q52KP5

Nxpe4, NXPE family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe4Q52KP5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nxpe4Q52KP5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nxpe4Q52KP5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nxpe4Q52KP5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nxpe4Q52KP5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nxpe4Q52KP5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nxpe4Q52KP5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nxpe4Q52KP5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nxpe4Q52KP5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms