Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1qtnf9Q4ZJN1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C1qtnf9Q4ZJN1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1qtnf9Q4ZJN1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms