Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Syne3Q4FZC9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syne3Q4FZC9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syne3Q4FZC9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Syne3Q4FZC9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syne3Q4FZC9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syne3Q4FZC9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Syne3Q4FZC9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Syne3Q4FZC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syne3Q4FZC9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms