Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5935Q497S0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm5935Q497S0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gm5935Q497S0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm5935Q497S0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm5935Q497S0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm5935Q497S0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm5935Q497S0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm5935Q497S0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gm5935Q497S0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm5935Q497S0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms