Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Defa20Q45VN2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa20Q45VN2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa20Q45VN2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa20Q45VN2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa20Q45VN2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms