Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc190Q3URK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc190Q3URK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc190Q3URK1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc190Q3URK1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc190Q3URK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc190Q3URK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms