Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMM4

Cdk10, Cyclin-dependent kinase 10, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk10Q3UMM4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk10Q3UMM4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk10Q3UMM4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk10Q3UMM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdk10Q3UMM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk10Q3UMM4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk10Q3UMM4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdk10Q3UMM4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms