Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Babam1Q3UI43 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Babam1Q3UI43 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Babam1Q3UI43 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Babam1Q3UI43 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Babam1Q3UI43 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Babam1Q3UI43 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Babam1Q3UI43 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Babam1Q3UI43 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Babam1Q3UI43 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Babam1Q3UI43 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Babam1Q3UI43 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Babam1Q3UI43 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms