Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Garem1Q3UFT3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Garem1Q3UFT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Garem1Q3UFT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Garem1Q3UFT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Garem1Q3UFT3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Garem1Q3UFT3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Garem1Q3UFT3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem1Q3UFT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Garem1Q3UFT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem1Q3UFT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Garem1Q3UFT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Garem1Q3UFT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms