Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trip13Q3UA06 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trip13Q3UA06 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trip13Q3UA06 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trip13Q3UA06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trip13Q3UA06 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trip13Q3UA06 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trip13Q3UA06 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trip13Q3UA06 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip13Q3UA06 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip13Q3UA06 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip13Q3UA06 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip13Q3UA06 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip13Q3UA06 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms