Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp13a5Q3TYU2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp13a5Q3TYU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp13a5Q3TYU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp13a5Q3TYU2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp13a5Q3TYU2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a5Q3TYU2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a5Q3TYU2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp13a5Q3TYU2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms